diff --git a/autogen.sh b/autogen.sh
index 0f32089a..17f6abf4 100755
--- a/autogen.sh
+++ b/autogen.sh
@@ -28,7 +28,6 @@ else
         gtkdocize
 fi
 
-cd $olddir
 if ! test -f libglnx/README.md || ! test -f bsdiff/README.md; then
     git submodule update --init
 fi
@@ -41,4 +40,5 @@ ln -sf ../libglnx/libglnx.m4 buildutil/libglnx.m4
 
 autoreconf --force --install --verbose
 
+cd $olddir
 test -n "$NOCONFIGURE" || "$srcdir/configure" "$@"